Objectifs:
Cette formation a pour objectifs:
- de présenter de manière accessible les concepts et méthodes de base de la bioinformatique.
- de familiariser les participants à l'utilisation d'outils bioinformatiques importants.
Contenu :
La formation alternera présentations théoriques et travaux pratiques sur ordinateur.
Le cours théorique abordera les questions suivantes:
- Introduction aux bases de données biologiques et aux principaux formats de données
- Manipulations et analyses de base des séquences biologiques
- Alignements des séquences biologiques et analyses phylogénétiques
- Recherche de motifs dans les protéines et les promoteurs
- Détermination de la structure des ARN
- Utilisation des données de structure des protéines
- Données génomiques et réseaux biologiques
Les travaux pratiques sur ordinateur permettront aux participants de se familiariser à l'utilisation des outils suivants:
- Analyses de sequences: EMBOSS, BLAST, ClustalW,...
- Analyses phylogénétiques: PHYLIP, MEGA,...
- Recherche des motifs: HMMER, Pfam, MEME,...
- Structure des ARN: Mfold, RNAfold,...
- Browsers génomiques
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